A、水稻叶肉细胞含有叶绿体、高尔基体、线粒体等细胞器，A正确；
B、果蝇细胞属于动物细胞，不含叶绿体，B错误；
C、家兔细胞属于动物细胞，不含叶绿体，C错误；
D、大肠杆菌属于原核生物，其细胞中只有核糖体一种细胞器，D错误．
故选：A．