A、甲图获取的是该细菌的全部DNA分子，因此用限制酶切割后可用于构建基因组文库，A正确；
B、乙图表示用反转录法获得的DNA分子，只包含该生物的部分基因，因此可建立该细菌的cDNA文库，B正确；
C、甲方法中，只要利用DNA限制性核酸内切酶将其原有的DNA切断即可，不需要以脱氧核苷酸为原料，C错误；
D、乙方法中d为逆转录过程，需要逆转录酶参与，D正确．
故选：C．