A、变异是不定向的，而自然选择是定向的，所以自然选择不能决定生物变异的方向，A错误；
B、生物进化的实质是种群基因频率的改变，而不是基因型频率的改变，B错误；
C、由于遗传和变异，种群内基因频率的改变在世代间具有连续性，C正确；
D、种群内基因频率改变的偶然性随种群数量下降而增大的，D错误．
故选：C．