根据题意分析可知：一个由n条肽链组成的蛋白质分子共有m个氨基酸，则脱水缩合时产生的水为m-n个；又每个氨基酸的平均相对分子质量为a，所以一个由n条肽链m个氨基酸组成的蛋白质分子的相对分子质量为am-18（m-n）．
故选：A．