A、噬菌体属于病毒，既不是真核生物，也不是原核生物，A错误；
B、酵母菌是真菌，属于真核生物，B错误；
C、团藻属于真核生物，C错误；
D、蓝藻属于原核生物，D正确．
故选：D．