每一条需要运输的多肽都含有一段氨基酸序列,称为信号肽序列,引导多肽至不同的转运系统.真核细胞中,当某一种多肽的N端开始合成不久,这种多肽去向就决定了.一部分核糖体以游离态存在于胞浆中只合成装配线粒体和叶绿体的蛋白质,还有一部分核糖体受新合成的多肽的N端的,信号肽的控制,进入内质网,使原来光滑的内质网变得粗糙,信号肽在转运到高尔基体的途中被切掉,粗糙内质网主要合成分泌蛋白,溶酶体蛋白和构成质膜骨架的蛋白.