双链DNA中含有的二个结构相同、方向相反的序列称为反向重复序列,也称为回文结构,每条单链以任一方向阅读时都是一样的,例如5'GGTACC3' 5'CCATGG3'.
回文结构序列是一种旋转对称结构,在轴的两侧序列相同而反向.当然这两个反向重复序列不一定是连续的.
短的回文结构可能是一种特别的信号,如限制性内切酶的识别位点.较长的回文结构容易转化成发夹结构.