A、氧气在血液中的运输需要血红蛋白，A不符合题意；
B、CO₂进入叶绿体的过程是自由扩散不需要载体蛋白协助，所以不需要蛋白质参与，B符合题意；
C、葡萄糖在细胞质基质内分解是无氧呼吸，需要无氧呼吸酶催化；在细胞质基质内分解成丙酮酸，然后在线粒体内分解是有氧呼吸，需要有氧呼吸酶催化．而酶大多数都是蛋白质，C不符合题意；
D、细胞识别依靠的是细胞膜上的糖蛋白，D不符合题意．
故选：B．