A、表现型相同，基因型不一定相同，A正确；
B、基因型相同，表现型可能由于环境不同而不同，B正确；
C、在相同的环境条件下，表现型相同，基因型也不一定相同，如显性纯合子与显性杂合子，C错误；
D、由C分析可知，D正确．
故选：C．