贝加尔湖的产生据说是因为亚洲地壳沿着一条断层慢慢拉开,出现了一条地沟.起初,这条地沟深八公里,但随着岁月流逝逐渐被淤泥填塞,从淤泥中的微生物化石可以显示其形成年代.湖底有温泉喷出,还经常发生微小的地震.有336条河流注入贝加尔湖,但只有一条河---安加拉河从湖泊流出.在冬季,湖水冻结至1米以上的深度,历时4-5个月.但是,湖内深处的温度一直保持不变,约3.5摄氏度.