同源染色体是在二倍体生物细胞中,形态、结构基本相同的染色体,并在减数第一次分裂(参考减数分裂)的四分体时期中彼此联会（若是三倍体及其他奇数倍体生物细胞,联会时会发生紊乱）,最后分开到不同的生殖细胞（即精子、卵细胞）的一对染色体,在这一对染色体中一个来自母方,另一个来自父方.而在同源染色体中,通常不谈x y 染色体,X Y染色体主要为部分同源的染色体,通常在谈及时,会将此另外谈论,因为在严格定义下同源染色体主要是在一对的染色体中 ,有同样的大小,形状,基因座,所以在此XY染色体则为不同大小,形状,所以有些书本中,不予认为是同源染色体.