蛋白质工程是通过改造基因的结构实现的，原因有两个：1、任何一种天然的蛋白质都是由基因决定的，改造了基因即对蛋白质进行改造，而且改造过的蛋白质可以遗传；2、对基因进行改造比对蛋白质直接改造要容易操作，难度要小得多．
故选：D．