原子晶体是一个在空间无限延伸的结构,其间只存在共价键的作用,结构十分稳定,硬度大；而分子晶体是一个个独立的个体,每个分子由共价键构成,但分子与分子之间是以分子间作用力相互影响的,分子间的作用力很弱,分子晶体具有较低的熔、沸点,硬度小、易挥发.
这里原子晶体中只存在共价键作用,而分子间存在分子间作用力（如范德华力、氢键）是区别的关键