（Ⅰ）由题意病毒细胞总数y关于时间x的函数关系式为y=2^x-1（其中x∈N^*），（3分）
则由2^x-1≤10⁸，两边取常用对数得（x-1）lg2≤8，从而x≤

8

lg2

+1＝27.58（6分）
即第一次最迟应在第27天注射该种药物．（7分）
（Ⅱ）由题意注入药物后小白鼠体内剩余的病毒细胞为2²⁶×2%，（8分）
再经过x天后小白鼠体内病毒细胞为2²⁶×2%×2^x，（10分）
由题意2²⁶×2%×2^x≤10⁸，（11分）
两边取常用对数得26lg2+lg2-2+xlg2≤8，解得x≤6.2（13分）
故再经过6天必须注射药物，即第二次应在第33天注射药物．（14分）