酒精和水都是由分子构成的，两者分子的大小不同，分子间间隔也不同，50mL的酒精和50mL的水混合体积小于100mL，是因为分子之间有间隔，一部分水分子和酒精分子会互相占据分子之间的间隔．
故答案为；分子之间有间隔，一部分水分子和酒精分子会互相占据分子之间的间隔．