这个要看捕获KIT
illumina最低一般50%多
agilent一般在70%多
nimblegen一般在85%左右
另外研究的物种也有一定影响,非模式生物的比对率会低一些
还有就是你研究物种的品系和设计探针捕获的参考数据的差一定也有关系.