利用DNA序列数据计算遗传距离最简单的方法是计算p距离（p-distance）,计算式为：p= nd /n,其中 n为所测定序列的核苷酸数,nd 为核苷酸差异数.p距离没有考虑同一个位点多个核苷酸间的替换状况,即将2个序列间核苷酸差异率作为彼此间的遗传距离.