（1）设可购买乙树苗x棵，则购买甲树苗（600-x）棵，
∴60（600-x）+80x≤44000．
x≤400．
答：最多可购买乙树苗400棵；
（2）设购买树苗的费用为y，
则y=60（600-x）+80x，
∴y=20x+36000，
根据题意0.88（600-x）+0.96x≥0.9×600，
∴x≥150，
∴当x=150时，y取最小值．
y_最小值=20×150+36000=39000．
答：当购买乙树苗150棵时费用最低，最低费用为39000元．