A．金属晶体由金属离子和自由电子构成，含有阳离子，但不含阴离子，故A错误；
B．原子晶体由非金属元素组成，只含有共价键，故B正确；
C．离子晶体可含有离子键和共价键，如NaOH，故C错误；
D．分子晶体中，构成分子的原子之间可形成化学键，如H₂O含有O-H键，故D错误．
故选B．