微生物包括：病毒界、原核生物界、原生生物界、真菌界.
病毒没有细胞结构；
原核生物包括一藻（蓝藻）、二菌（细菌、放线菌）、三体（衣原体、支原体、立克次氏体）；
下面是真核微生物：
原生生物包括草履虫、变形虫、疟原虫等.
真菌包括酵母菌、霉菌（青霉）、大型真菌（蘑菇）等.