穿梭质粒一般都是人工构建的,由于穿梭质粒中存在既能够适应在原核生物中表达的各种基因片段以及相关的酶切位点、选择标记以及复制起点,也存在适应于真核生物中表达的相应片段及复制起点,所以穿梭质粒既能够在真核生物中表达,也能在原核生物中表达.