细菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质和DNA集中的区域，没有成形的细胞核，没有叶绿体．
植物细胞有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核、液泡和叶绿体．因此细菌与植物细胞相比，细菌没有的结构是真正（成形）的细胞核、液泡和叶绿体等．观察以上选项，只有D符合题意．
故选：D