如图所示：
①若直观图中平行四边形的边A′B′=4，
则原正方形的边长AB=A′B′=4，故该正方形的面积S=4²=16．
②若直观图中平行四边形的边A′D′=4，
则原正方形的边长AD=2A′D′=8，故该正方形的面积S=8²=64．
故选C．