A、水是纯净物，不含有其他物质，双氧水中不含氢分子，故此项错误．
B、水和双氧水中溶质的化学式分别是H₂O和H₂O₂，可见它们都含有由氢元素，所以正确．
C、水和双氧水中都不含有氢分子，故此项错误．
D、水和过氧化氢的化学式分别是H₂O和H₂O₂，它们的一个分子中含有都含有两个氢原子，不在一个分子这个条件下，这种说法错误．
故选：B．