两个都是has
been 是系动词be的过去分词形式,所以起系动词的作用.
这两句都是现在完成时.
不过第一句How's your father been?属于日常用语的范畴,不能简单用现在完成时来解释.通常“How have you been (doing)?”之类的用于很久不见对方时.