不同点在于它们催化的底物或反应不同
DNA聚合酶：
在DNA复制时起作用,将多个脱氧核苷酸催化聚合为脱氧核苷酸链（也就是DNA单链）,此时形成的化学键是磷酸二酯键.
DNA解旋酶：
在DNA复制或转录时起作用,将DNA的双链解开,作用对象是氢键,使氢键断裂
DNA水解酶：
在消化道或细胞内起作用,将DNA水解为脱氧核苷酸,作用对象是磷酸二酯键
DNA连接酶：
在DNA修饰过程或基因工程中起作用,将两个DNA片段连接起来,此时形成的化学键是磷酸二酯键.