根据分析，这堆苹果的最少的数量是12、16的最小公倍数，
因为12=2×2×3，16=2×2×2×2，
所以12、16的最小公倍数是：
2×2×2×2×3=48
即这堆苹果至少有48只．
答：这堆苹果至少有48只．