∵方程ax²+bx+c=0的两个根是-3和1，
∴二次函数y=ax²+bx+c的图象与x轴的交点分别为（-3，0），（1，0）．
∵此两点关于对称轴对称，
∴对称轴是直线x=

−3+1

2

=-1．
故选C．