会.
Y染色体极其小,与X染色体差异极大,二者相比较,Y染色体包含的遗传信息比X染色体少很多,各自有很多自己的特异基因,和对方无关.
但是二者也有同源区段,粗线期（减一前期的一个时期）的时候同源部分会进行交换,非同源部分,就不会相互接近了.