A、番茄属于高等植物，其细胞中具有叶绿体，A错误；
B、水稻属于高等植物，其细胞中具有叶绿体，B错误；
C、蓝细菌属于原核生物，由于其细胞中具有叶绿素和藻蓝素，因此能够进行光合作用，但是没有叶绿体，C正确；
D、酵母菌没有叶绿体，也不能进行光合作用，D错误．
故选：C．