分两类：一类是位于活性中心外,即不参与构成活性中心,但是维持酶活性中心必需的；另一类位于活性中心内（又分两类：一类是结合基团,起作用是与底物结合,使底物和一定构象的酶形成复合物,即中间产物；另一类是催化基团,其作用是改变底物中某些化学键的稳定性,使底物发生反应生成产物）