属于基因重组.
一般病毒的DNA都非常短,整合到人的基因里从染色体的尺度几乎看不出明显变化.而且病毒DNA不是以染色体的方式存在的,染色体变异指的是在染色体的层面发生的变化（缺失、重复、倒转……）,与基因重组相比对整体的DNA改变大得多,所以往往会造成很严重的遗传病.
对于你的补充,所谓的基因整合与前面所说的基因插入都是指的一个意思,仅仅是换了个名称而已,当然不属于染色体变异了.记住,病毒基因不以染色体形式存在,所以涉及病毒的基因变化都不用考虑染色体!