细菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质和DNA集中的区域，没有成形的细胞核，没有叶绿体；真菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，没有叶绿体．因此细菌与真菌的根本区别在于真菌具有成形细胞核，细菌没有成形的细胞核，只有DNA集中的区域．酵母菌是真菌，醋酸菌是细菌．因此醋酸杆菌与酵母菌的本质区别是酵母菌细胞内有真正的细胞核．
故选B．