A、有丝分裂中期和减数第二次分裂后期细胞中染色体数目都与体细胞相同，A正确；
B、有丝分裂中期，基因型为AAaaBBbb，而减数第二次分裂后期，基因型为AABB或AAbb或aaBB或aabb，B错误；
C、有丝分裂中期，细胞中所含同源染色体对数与体细胞相同，而减数第二次分裂后期，细胞中不含同源染色体，C错误；
D、有丝分裂中期，细胞中所含DNA数目是体细胞的2倍，而减数第二次分裂后期，细胞中所含DNA数目与体细胞相同，D错误．
故选：A．