延伸是给出合成扩增子的时间.扩增子较小时（一两百个碱基对）,很快就能够合成完毕,延伸步骤不是很重要,但是如果扩增子较大（几千碱基对）,则不给出足够延伸时间便无法合成完整的扩增子.合成/扩增速度是看DNA聚合酶的性质.通常建议的设置是眉一千bp给一分钟延伸时间.