A、酵母菌和草履虫都是真核生物，都含有染色体，A正确；
B、乳酸菌和蓝藻都是原核生物，两者都没有成形的细胞核，因此都没有染色体，B错误；
C、水螅和团藻都是真核生物，都含有染色体，C正确；
D、蚯蚓和蛔虫都是真核生物，都含有染色体，D正确．
故选：B．