①培育无籽番茄的原理是生长素能促进子房发育成果实，与植物激素有关；
②培育三倍体无籽西瓜的原理是多倍体育种，与植物激素无关；
③果树整枝修剪是消除顶端优势，与生长素作用的两重性有关；
④带芽的枝条扦插的原因是芽能产生生长素，促进插条生根，与植物激素有关；
⑤移栽植物时剪去部分叶片是降低蒸腾作用，提高成活率，与植物激素无关；
⑥棉花摘心是消除顶端优势，与生长素作用的两重性有关．
故选：D．