某些有害的物质（如：农药、化肥使用；工业废水；生活污水；医院污水等）进入水体,超过其自净能力,引起天然水体的物理上、化学上的变化.
水源污染主要有两种形式：
一是自然污染：因地质的溶解作用,降水对大气的淋洗、对地面的冲刷,挟带各种污染物流入水体而形成；
二是人为的污染,即工业废水、生活污水、农药化肥等对水体的污染.后一种是比较严重的,但也是可以控制的.
水源的污染源主要有七种：即病原体污染、需氧物质污染、植物性营养物污染、热污染、放射性污染、盐污染和有机物与重金属污染等.