水生态系统(aquatic ecosystem) 由水生生物群落与水环境共同构成的具有特定结构和功能的动态平衡系统
水生生态系统是地球表面各类水域生态系统的总称.水生生态系统中栖息着自养生物（藻类、水草等）、异养生物（各种无脊椎和脊椎动物）和分解者生物（各种微生物）群落.各种生物群落及其与水环境之间相互作用,维持着特定的物质循环与能量流动,构成了完整的生态单元.
水域系统中生物与生物、生物与非生物因子之间相互作用的统一体.包括内陆水域(湖泊、水库、河流、湿地等)、河口和海洋生态系统等.