拉普拉塔河-巴拉那河全流域属亚热带湿润气候,四季皆有降雨,年降雨量1200～2400mm.　　巴拉那河流域北部为热带气候,夏季(12～5月)多雨,冬季(7～11月)干旱.中、下游地区属温和湿润的亚热带气候,夏季炎热、冬季较冷.伊瓜苏河流域的一些地区年平均气温为14℃,由伊瓜苏瀑布往北沿巴拉那河流域一些低地和向西到该流域的边界,年平均气温增至22℃.巴拉那河流域年均降水深1240mm,降水总量37000亿m,其中32000亿m来源于海洋,其余5000亿m属于流域内水气循环,仅占总降水量的14%巴拉那河上游河水流速随河道的宽窄变化而变化,在瓜伊拉瀑布以上,流速较慢；而在瀑布下游的峡谷河段,流速则急剧增大.狭窄河段以下至阿根廷的波萨达斯一段,流速逐渐减小,但在其下游河段,由于有一连串急流、险滩,流速又增大.科连特斯以下,流速又变慢,直到拉普拉塔河,平均流速稳定在1.12m/s左右.