There is a little ink in the bottle,(isn't there)?
瓶子里有一些墨水,不是吗?
陈述部分的a little（有一些）意思是肯定的,疑问部分应该用否定isn't there.
如果陈述部分用的是little（否定词,意思为“几乎没有”）,这时疑问部分才是要填is there.