A、农田生态系统是人工控制的生态系统，物种比较单一，因此群落结构比较简单，而草原生态系统中的群落结构具有明显的垂直结构和水平结构，A正确；
B、群落水平结构是由于地形的起伏、光照的阴暗、湿度的大小等因素的影响，B正确；
C、我国南方热带雨林气候条件适宜，因此分解者的代谢活动比北方森林中的强，C错误；
D、植物可通过光合作用将大气中的碳元素固定到生物群落中，同时也可以通过呼吸作用将碳以二氧化碳的形式释放到空气中去，D正确．
故选：C．