1：可以这么说,细胞色素C仅存在线粒体内,细胞色素C1是线粒体内膜上的嵌入蛋白,细胞色素C是电子传递链中唯一的外周蛋白,它位于线粒体内膜外侧.
2：首先声明一下,ATP的产生直接原因是H+离子势（质子势）,植物ATP合成是以膜内外质子浓度差和电位差作为质子动力,即为光和磷酸化动力.当H+离子沿着浓度梯度返回膜外侧时,在ATP合酶催化下,ADP和Pi脱水形成ATP.
叶绿体内也有相应的电子传递和质子传递,与线粒体内的不同.通过电子传递和质子传递将膜内外两侧的质子势发生改变,膜内高,膜外低.每一次,都将H+离子留在膜内,产生了质子势.
3：没有细胞色素C,在植物叶绿体中电子传递链有六部分组成,固定的有PS2（光系统2）Cytb6f复合体（细胞色素b6f复合体）、PS1、ATP合酶.游动的有质体鲲（简称质鲲）和质蓝素（PQ）.其中质鲲游动于PS2和Cytb6f复合体之间,PC游动于Cytb6f复合体和PS1之间.