染色体DNA指在细胞核内组成染色体的DNA,细胞质DNA指在细胞质的一些细胞器内包含的DNA,如线粒体DNA、叶绿体DNA.
真核细胞进行有丝分裂时,染色体DNA经复制后,平均分配到两个子细胞中；细胞质DNA也会复制,但不会平均分配到两个子细胞中.