脱氧核糖核苷酸是脱氧核糖核酸最小的活性分子,由碱基-脱氧核糖-磷酸构成,而核酸是由四种核苷酸通过化学键组成的双螺旋结构,就是通常意义上的DNA.
脱氧核糖核苷酸的碱基有：腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）和胸腺嘧啶（T）.
与核糖核苷酸的区别在五碳糖与碱基上,核糖核苷酸的碱基中没有胸腺嘧啶,而是尿嘧啶
脱氧核糖核苷酸的3'-OH上没有氧原子,核糖核苷酸的3'-OH有氧原子.