A.不是标准状况下,不能使用标况下的气体摩尔体积计算2.24L氯气的物质的量,故A错误;
B.0.1L 3mol•L-1 NH4NO3溶液中含有溶质硝酸铵0.3mol,0.3mol硝酸铵中含有0.6mol氮原子,含有的N原子数目为0.6×6.02×1023,故B错误;
C.5.6g铁的物质的量为0.1mol,0.1mol铁与硫酸铜溶液反应能够置换出0.1mol铜,反应生成的铜原子数为0.1×6.02×1023,故C错误;
D.46gNO2和N2O4中含有1mol最简式NO2,含有3mol原子,混合物中含有的原子数为3×6.02×1023,故D正确;
故选D.