好多时候还真得靠自己的感觉去说.
我觉得应该是说去年那时已经是完成了这个命令（ had been instructed）,也就是说强调的是这个记者 （journalist）去年已经被命令写那篇文章了,而不是强调他被命令这个动作.当然这句话也能用 was instructed ,但结果就是强调被命令这个动作了,而没说是否已经完成了这个动作.这句子用过去完成时隐含他已经完成了这个命令的意思.
个人见解,仅供参考!