A、霉菌的菌丝体通过有丝分裂产生配子，而有丝分裂间期可能会发生基因突变，A正确；
B、基因突变一般发生在分裂间期，B错误；
C、基因突变一般发生在分裂间期，C错误；
D、霉菌属于单倍体阶段，不进行减数分裂，D错误．
故选：A．