相似点有：①分子和原子都是构成物质的基本微粒.有的物质由分子构成.如氧气由氧分子构成；二氧化碳由二氧化碳分子构成.有的物质由原子构成.如金刚石由碳原子构成.②分子和原子的体积都很小.③分子和原子质量都很小,但仍有质量,如一个水分子的质量为2.99×10-26 kg,一个氧原子的质量为2.657×10-26 kg.④分子和原子都在不停地运动着.⑤分子间和原子间都有一定的间隔.物质在不同的条件下有三态变化主要是由于分子间或原子间的间隔大小变化的缘故.⑥分子和原子都有可分性,又都具有不可分性.⑦分子间和原子间都有相互作用.如,氧气、氢气在常温下是气体,当加压降温时能凝结为液体,进一步还可以凝固成固体.这就说明分子间存在着相互作用,作用大小和分子间的距离及质量有关系,此外,每两个氧原子能结合成一个氧分子,每个氧分子在通常情况下都不能分开成两个氧原子.这就说明原子间也有相互作用.不同点有：①在化学反应中分子分解成原子,而原子却不能再分.②分子能独立存在,原子一般来说不能独立存在.联系点：分子是由原子构成的.原子是构成分子的微粒,原子也是直接构成物质的一种微粒.