A、Cl原子的最外层电子数为7，和1个电子形成共价键达到稳定结构，氯气中含有1个共用电子对；
B、N原子的最外层电子数为5，和3个电子形成共价键达到稳定结构，氨气中含有3个共用电子对；
C、O原子核外有6个电子，和2个电子形成共价键达到稳定结构，水分子中含有2个共用电子对；
D、C原子的最外层电子数为4，和4个电子形成共价键达到稳定结构，二氧化碳分子中含有4个共用电子对，
故选D．